Koskaan ihmiskunnan historiassa ei ole ollut näin paljon tietoa Taksonomiaan (biologiaan) tutustuminen vuonna 2023: Kattava opas kuten nykyään Internetin ansiosta. Kuitenkin tämä pääsy kaikkeen liittyvään Taksonomiaan (biologiaan) tutustuminen vuonna 2023: Kattava opas ei ole aina helppoa. Kylläisyys, huono käytettävyys ja vaikeus erottaa oikeat ja väärät tiedot Taksonomiaan (biologiaan) tutustuminen vuonna 2023: Kattava opas niitä on usein vaikea voittaa. Tämä motivoi meitä luomaan luotettavan, turvallisen ja tehokkaan sivuston.
Meille oli selvää, että tavoitteemme saavuttamiseksi ei riittänyt, että meillä oli oikeaa ja varmennettua tietoa Taksonomiaan (biologiaan) tutustuminen vuonna 2023: Kattava opas . Kaikki, mistä olimme keränneet Taksonomiaan (biologiaan) tutustuminen vuonna 2023: Kattava opas piti myös esittää selkeästi, luettavalla tavalla, käyttökokemusta helpottavalla rakenteella, selkeällä ja tehokkaalla suunnittelulla sekä latausnopeudella etusijalla. Olemme varmoja, että olemme saavuttaneet tämän, vaikka pyrimme jatkuvasti tekemään pieniä parannuksia. Jos olet löytänyt sen, mistä olet löytänyt hyödyllistä Taksonomiaan (biologiaan) tutustuminen vuonna 2023: Kattava opas ja olet tuntenut olosi mukavaksi, olemme erittäin iloisia, jos palaat scientiaen.com aina kun haluat ja tarvitset.
Osa sarjasta |
Evoluutiobiologia |
---|
![]() |
In biologia, taksonomia (Alkaen Muinainen Kreikka τάξις (Taksit) "järjestely" ja -νομία (- nomia) 'menetelmä') on tieteellinen nimeämisen, määrittelemisen tutkimus (rajoittava) ja biologisten ryhmien luokittelu organismit yhteisten ominaisuuksien perusteella. Organismit on ryhmitelty taksonien (yksikkö: taksoni) ja näille ryhmille annetaan a taksonominen sijoitus; tietyn tason ryhmiä voidaan koota yhteen kattavamman ryhmän muodostamiseksi korkeammalla tasolla, mikä luo taksonomisen hierarkian. Tärkeimmät nykyaikaisen käytön arvot ovat verkkotunnuksen, valtakunta, turvapaikka (jako käytetään joskus kasvitieteessä tilalle turvapaikka), luokka, tilata, perhe, sukuja laji. Ruotsalainen kasvitieteilijä Carl linnaeus pidetään nykyisen taksonomiajärjestelmän perustajana, koska hän kehitti paremmuusjärjestyksen, joka tunnetaan nimellä Linnaelainen taksonomia eliöiden luokitteluun ja binomiaalinen nimikkeistö eliöiden nimeämiseen.
Biologisen systematiikan teorian, tietojen ja analyyttisen tekniikan edistymisen myötä Linnaean järjestelmä on muuttunut nykyaikaisen biologisen luokituksen järjestelmäksi, jonka tarkoituksena on heijastaa evoluutio- sekä elävien että sukupuuttoon kuolleiden organismien väliset suhteet.
Taksonomian tarkka määritelmä vaihtelee lähteestä toiseen, mutta tieteenalan ydin säilyy: organismiryhmien käsitys, nimeäminen ja luokittelu. Viitepisteinä alla on esitetty viimeaikaiset taksonomian määritelmät:
Vaihtelevat määritelmät joko asettavat taksonomian systematiikan osa-alueeksi (määritelmä 2), kääntävät tämän suhteen (määritelmä 6) tai näyttävät pitävän näitä kahta termiä synonyymeinä. Siitä on jonkin verran erimielisyyttä biologinen nimikkeistö pidetään osana taksonomiaa (määritelmät 1 ja 2) tai osana taksonomian ulkopuolista systematiikkaa. Esimerkiksi määritelmä 6 on yhdistetty seuraavan systematiikan määritelmän kanssa, joka asettaa nimikkeistön taksonomian ulkopuolelle:
Vuonna 1970 Michener et ai. määritellään "systeeminen biologia" ja "taksonomia" (termit, joita usein sekoitetaan ja käytetään keskenään) suhteessa toisiinsa seuraavasti:
Systemaattinen biologia (jäljempänä yksinkertaisesti systematiikka) on ala, joka (a) tarjoaa tieteellisiä nimiä organismeille, (b) kuvaa niitä, (c) säilyttää niiden kokoelmia, (d) tarjoaa organismeille luokituksia, avaimia niiden tunnistamiseen ja tietoja niiden levinneisyydestä, (e) tutkii niiden evoluutiohistoriaa ja (f) harkitsee niiden ympäristöön sopeutumista. Tämä on pitkä historia ala, joka on viime vuosina kokenut huomattavan renessanssin, lähinnä teoreettisen sisällön osalta. Osa teoreettisesta materiaalista liittyy evoluutioalueisiin (aiheet e ja f edellä), loput liittyvät erityisesti luokitteluongelmaan. Taksonomia on osa Systematiikkaa, joka koskee yllä olevia aiheita (a) (d).
Kokonainen joukko termejä, mukaan lukien taksonomia, systemaattinen biologia, systematiikka, biosystematiikka, tieteellinen luokittelu, biologinen luokittelu ja filogenetiikka niillä on toisinaan ollut päällekkäisiä merkityksiä – joskus samoja, joskus hieman erilaisia, mutta aina liittyviä ja risteäviä. Tässä käytetään "taksonomian" laajinta merkitystä. Itse termin otettiin käyttöön vuonna 1813 de Candolle, hänen Kasvitieteellinen elementti. John Lindley esitti systematiikan varhaisen määritelmän vuonna 1830, vaikka hän kirjoitti "systeemisestä kasvitiikasta" sen sijaan, että käytti termiä "systematiikka". Eurooppalaisilla on tapana käyttää termejä "systematiikka" ja "biosystematiikka" tutkiessaan biologista monimuotoisuutta kokonaisuudessaan, kun taas pohjoisamerikkalaiset käyttävät "taksonomiaa" useammin. Kuitenkin taksonomia, ja erityisesti alfa taksonomia, on tarkemmin sanoen organismien tunnistaminen, kuvaus ja nimeäminen (eli nimikkeistö), kun taas "luokitus" keskittyy organismien sijoittamiseen hierarkkisiin ryhmiin, jotka osoittavat niiden suhteen muihin organismeihin.
A taksonominen tarkistus or taksonominen katsaus on uusi analyysi tietyn kohteen vaihtelukuvioista taksoni. Tämä analyysi voidaan suorittaa minkä tahansa erilaisten käytettävissä olevien merkkien yhdistelmän perusteella, kuten morfologiset, anatomiset, palynologiset, biokemialliset ja geneettiset. A monografia tai täydellinen versio on versio, joka on kattava taksonille tietyllä hetkellä annetuille tiedoille ja koko maailmalle. Muut (osittaiset) versiot voivat olla rajoitettuja siinä mielessä, että ne voivat käyttää vain joitain saatavilla olevista merkistöistä tai niillä on rajoitettu alueellinen laajuus. Revisio johtaa tutkittavan taksonin alataksojen välisiin suhteisiin tai uusiin näkemyksiin, mikä voi johtaa näiden alataksojen luokituksen muutokseen, uusien alataksojen tunnistamiseen tai aikaisempien alataksojen yhdistämiseen.
Taksonomiset merkit ovat taksonomisia attribuutteja, joita voidaan käyttää osoittamaan, mistä suhteista ( fylogenia) taksonien välillä päätellään. Tällaisia taksonomisia merkkejä ovat:
Termi "alfa taksonomia" käytetään nykyään ensisijaisesti viittaamaan etsimiseen, kuvaamiseen ja nimeämiseen taksonien, erityisesti lajit. Aikaisemmassa kirjallisuudessa termillä oli erilainen merkitys, viitaten morfologiseen taksonomiaan ja 19-luvun lopun tutkimustuloksiin.
William Bertram Turrill esitteli termin "alfa taksonomia" vuosina 1935 ja 1937 julkaistuissa artikkeleissa, joissa hän käsitteli taksonomian tieteenalan filosofiaa ja mahdollisia tulevaisuuden suuntauksia.
... taksonomistien keskuudessa on lisääntyvä halu pohtia ongelmiaan laajemmista näkökulmista, tutkia mahdollisuuksia tiiviimpään yhteistyöhön sytologisten, ekologisten ja geneettisten kollegojensa kanssa ja todeta, että jokin tarkistus tai laajennus, ehkä luonteeltaan radikaali, Niiden tavoitteista ja menetelmistä voi olla toivottavaa... Turrill (1935) on ehdottanut, että vaikka hyväksyykin vanhan korvaamattoman arvokkaan taksonomian, joka perustuu rakenteeseen ja jota kutsutaan kätevästi "alfaksi", on mahdollista nähdä kaukainen taksonomia, joka perustuu mahdollisimman laaja morfologisten ja fysiologisten tosiseikkojen perusta ja jossa "löydetään paikka kaikille havainnollisille ja kokeellisille tiedoille, jotka liittyvät, vaikkakin epäsuorasti, lajien ja muiden taksonomisten ryhmien rakenteeseen, alajakoon, alkuperään ja käyttäytymiseen". Voidaan sanoa, että ihanteita ei voida koskaan täysin toteuttaa. Niillä on kuitenkin suuri arvo toimia pysyvinä piristeinä, ja jos meillä on jokin, jopa epämääräinen, "omega"-taksonomian ideaalinen, voimme edetä hieman alaspäin kreikkalaisessa aakkosessa. Jotkut meistä miellyttävät itseään ajattelemalla, että haparoimme nyt "beta" taksonomiassa.
Turrill siis nimenomaisesti sulkee alfa-taksonomian ulkopuolelle useita tutkimusalueita, jotka hän sisällyttää taksonomiaan kokonaisuutena, kuten ekologia, fysiologia, genetiikka ja sytologia. Lisäksi hän sulkee pois fylogeneettisen rekonstruoinnin alfataksonomiasta.
Myöhemmät kirjoittajat ovat käyttäneet termiä eri merkityksessä, tarkoittaen lajien (ei alalajien tai muun luokan taksonien) rajaamista käyttämällä mitä tahansa saatavilla olevaa tutkimustekniikkaa, mukaan lukien pitkälle kehitetyt laskennalliset tai laboratoriotekniikat. Täten Ernst Mayr vuonna 1968 määritelty "beta taksonomia" lajia korkeampien luokitusten luokituksena.
Muuntelun biologisen merkityksen ja sukulaislajien ryhmien evolutionaarisen alkuperän ymmärtäminen on vielä tärkeämpää taksonomisen toiminnan toisessa vaiheessa, lajien lajittelussa sukulaisryhmiin ("taksoihin") ja niiden järjestymiseen hierarkiaan. korkeammat luokat. Tätä toimintaa termi luokitus tarkoittaa; sitä kutsutaan myös "beeta-taksonomiaksi".
Se, miten lajit tulisi määritellä tietyssä organismiryhmässä, aiheuttaa käytännön ja teoreettisia ongelmia, joita kutsutaan nimellä lajiongelma. Tieteellistä työtä lajien määrittelemiseksi on kutsuttu mikrotaksonomiaksi.[epäluotettava lähde?] Laajennuksena makrotaksonomia on korkeampien ryhmien tutkimus taksonomiset sijoitukset alasuku ja sitä korkeammat.
Vaikka joissakin taksonomisen historian kuvauksissa yritetään ajoittaa taksonomia muinaisiin sivilisaatioihin, aidosti tieteellinen yritys luokitella organismeja tapahtui vasta 18-luvulla. Aiemmat teokset olivat pääasiassa kuvailevia ja keskittyivät kasveihin, joista oli hyötyä maataloudessa tai lääketieteessä. Tässä tieteellisessä ajattelussa on useita vaiheita. Varhainen taksonomia perustui mielivaltaisiin kriteereihin, niin sanottuihin "keinotekoisiin järjestelmiin", mukaan lukien Linnékasvien sukupuoliluokitusjärjestelmä (Linnaeuksen 1735 eläinten luokittelu oli nimeltään "Systema Naturae" ("Luonnon järjestelmä"), mikä tarkoittaa, että hän ainakin uskoi, että se oli enemmän kuin "keinotekoinen järjestelmä". Myöhemmin syntyi järjestelmiä, jotka perustuivat taksonien ominaisuuksien täydellisempään tarkasteluun, joita kutsutaan "luonnollisiksi". järjestelmät", kuten de Jussieu (1789), de Candolle (1813) ja Bentham ja Hooker (1862-1863). Nämä luokitukset kuvasivat empiirisiä malleja ja olivat ennenevoluutio- ajattelussa. Julkaisun Charles Darwin's Lajien alkuperästä (1859) johti uuteen evoluutiosuhteisiin perustuvaan luokitteluun. Tämä oli käsite fyleettinen järjestelmät vuodesta 1883 eteenpäin. Tämä lähestymistapa oli tyypillistä Eichler (1883) ja englantilainen (1886-1892). Tuleminen kladistinen Metodologia johti 1970-luvulla luokitteluihin, jotka perustuivat ainoaan kriteeriin yksinäisesti, jota tukee läsnäolo synapomorfiat. Siitä lähtien todistuspohjaa on laajennettu tiedoilla vuodesta molekyyligenetiikka joka suurelta osin täydentää perinteistä morfologia.[tarvittava sivu][tarvittava sivu][tarvittava sivu]
Ihmisen ympäristön nimeäminen ja luokittelu alkoi todennäköisesti kielen alkaessa. Myrkyllisten kasvien erottaminen syötävistä kasveista on olennainen osa ihmisyhteisöjen selviytymistä. Lääkekasvikuvitukset näkyvät egyptiläisissä seinämaalauksissa c. 1500 BC, mikä osoittaa, että eri lajien käyttötarkoitukset ymmärrettiin ja että perustaksonomia oli käytössä.
Organismit luokiteltiin ensin Aristoteles (Kreikka, 384–322 eKr.) oleskelunsa aikana Lesboksen saari. Hän luokitteli olennot niiden osien mukaan tai nykyaikaisin termein attribuutteja, kuten elävänä syntymä, neljä jalkaa, muninta, verta tai lämmin keho. Hän jakoi kaikki elävät olennot kahteen ryhmään: kasveihin ja eläimiin. Jotkut hänen eläinryhmistään, kuten Anhaima (eläimet ilman verta, käännettynä selkärangattomat) Ja Enhaima (eläimet, joissa on verta, suunnilleen selkärankaiset), sekä ryhmät, kuten hait ja valaiden, ovat edelleen yleisessä käytössä. Hänen oppilaansa Theofrastos (Kreikka, 370–285 eaa.) jatkoi tätä perinnettä ja mainitsi kirjassaan noin 500 kasvia ja niiden käyttötarkoituksia. Historia Plantarum. Jälleen useita tällä hetkellä vielä tunnistettuja kasviryhmiä voidaan jäljittää Theophrastuksesta, kuten Sarvipäinen, krookusja Narkissos.
Taksonomia vuonna Keskiaika perustui suurelta osin Aristoteelinen järjestelmä, lisäyksillä, jotka koskevat olentojen filosofista ja eksistentiaalista järjestystä. Tämä sisälsi käsitteitä, kuten mahtava olemisen ketju Lännessä skolastinen perinne, Johtuu jälleen lopulta Aristoteleesta. Aristoteelinen järjestelmä ei luokitellut kasveja tai sienetmikroskooppien puuttumisen vuoksi, koska hänen ajatuksensa perustuivat koko maailman järjestämiseen yhdeksi jatkumoksi scala naturae (Luonnolliset tikkaat). Tämäkin otettiin huomioon suuressa olemisen ketjussa. Edistystä tekivät tutkijat, kuten Prokopius, Timotheos Gazasta, Demetrios Pepagomenosja Thomas Aquinas. Keskiajan ajattelijat käyttivät abstrakteja filosofisia ja loogisia luokitteluja, jotka sopivat paremmin abstraktiin filosofiaan kuin pragmaattiseen taksonomiaan.
Aikana Renessanssi ja Valistuksen, organismien luokittelu yleistyi, ja taksonomisista teoksista tuli tarpeeksi kunnianhimoisia korvaamaan muinaiset tekstit. Tämä johtuu joskus kehittyneiden optisten linssien kehittämisestä, mikä mahdollisti organismien morfologian tutkimisen paljon yksityiskohtaisemmin. Yksi varhaisimmista kirjoittajista, joka käytti hyväkseen tätä teknologian harppausta, oli italialainen lääkäri Andrea Cesalpino (1519–1603), jota on kutsuttu "ensimmäiseksi taksonomistiksi". Hänen magnum opus De Plantis ilmestyi vuonna 1583 ja kuvasi yli 1500 kasvilajia. Kaksi suurta kasviperhettä, jotka hän ensimmäisenä tunnisti, ovat edelleen käytössä: Asteraceae ja Brassicaceae. Sitten 17-luvulla John Ray (Englanti, 1627–1705) kirjoitti monia tärkeitä taksonomisia teoksia. Epäilemättä hänen suurin saavutuksensa oli Methodus Plantarum Nova (1682) jossa hän julkaisi yksityiskohtia yli 18,000 XNUMX kasvilajista. Tuolloin hänen luokituksensa olivat ehkä monimutkaisimmat, mitä kukaan taksonomisti oli tuottanut, koska hän perusti taksoninsa moniin yhdistettyihin hahmoihin. Seuraavat suuret taksonomiset teokset tuotti Joseph Pitton de Tournefort (Ranska, 1656–1708). Hänen työnsä vuodelta 1700 Institutiones Rei Herbariae, sisälsi yli 9000 lajia 698 suvussa, mikä vaikutti suoraan Linnaeukseen, koska sitä hän käytti nuorena opiskelijana.
Ruotsalainen kasvitieteilijä Carl linnaeus (1707-1778) aloitti uuden taksonomian aikakauden. Hänen tärkeimpien teoksiensa kanssa Systema Naturae Ensimmäinen painos vuonna 1, Laji Plantarum in 1753, ja Systema Naturae 10th Edition, hän mullisti modernin taksonomian. Hänen teoksessaan toteutettiin standardoitu binomiaalinen nimeämisjärjestelmä eläin- ja kasvilajeille, joka osoittautui tyylikkääksi ratkaisuksi kaoottiseen ja hajanaiseen taksonomiseen kirjallisuuteen. Hän ei ainoastaan esitteli luokan, järjestyksen, suvun ja lajin standardeja, vaan myös mahdollisti kasvien ja eläinten tunnistamisen kirjastaan käyttämällä kukan pienempiä osia. Näin ollen Linnaean järjestelmä syntyi ja sitä käytetään edelleen olennaisesti samalla tavalla kuin 18-luvulla. Tällä hetkellä kasvi- ja eläintaksonomit pitävät Linnaeuksen työtä "lähtökohtana" kelvollisille nimille (vuonna 1753 ja 1758). Ennen näitä päivämääriä julkaistuja nimiä kutsutaan "pre-Linnaeaniksi", eikä niitä pidetä kelvollisina (poikkeuksena vuonna julkaistut hämähäkit Svenska Spindlar). Jopa Linnaeuksen itsensä ennen näitä päivämääriä julkaisemia taksonomisia nimiä pidetään esilinnaina.
Ryhmiin sisäkkäisten ryhmien malli määriteltiin Linnaeuksen kasvien ja eläinten luokitteluissa, ja näitä malleja alettiin esittää dendrogrammit eläimestä ja kasvista kuningaskuntia 18-luvun lopulla, paljon ennen Charles Darwinia Lajien alkuperästä julkaistiin. "Luonnollisen järjestelmän" malli ei sisältänyt generoivaa prosessia, kuten evoluutiota, mutta saattoi vihjata sen, inspiroimalla varhaisia transmutaatiomielisiä ajattelijoita. Varhaisten teosten joukossa, jotka tutkivat ajatusta a lajien transmutaatio olivat Erasmus darwin's (Charles Darwinin isoisän) 1796 Zoönomia ja Jean Baptiste Lamarck's Philosophie Zoologique ja 1809. Ajatusta suosittelivat anglofonisessa maailmassa spekulatiiviset, mutta laajalti luetut Luomisen luonnonhistorian jäännökset, julkaissut nimettömänä Robert Chambers vuonna 1844.
Darwinin teorian myötä ilmeni nopeasti yleinen hyväksyntä, jonka mukaan luokituksen tulisi heijastaa darwinilaista periaatetta yhteinen syntyperä. Elämän puu esityksistä tuli suosittuja tieteellisissä töissä, kun tunnetut fossiiliryhmät sisällytettiin. Yksi ensimmäisistä nykyaikaisista fossiilisiin esivanhemmiin sidottuista ryhmistä oli linnut.[muokkaa] Käyttämällä tuolloin äskettäin löydettyjä fossiileja Archaeopteryx ja hesperornis, Thomas Henry Huxley julisti, että ne olivat kehittyneet dinosauruksista, ryhmästä, jonka virallisesti nimesi Richard Owen vuonna 1842. Tuloksena oleva kuvaus dinosauruksista, jotka "synnyttävät" tai ovat "lintujen esi-isiä", on olennainen tunnusmerkki evoluution taksonominen ajattelu. Kun yhä enemmän fossiiliryhmiä löydettiin ja tunnistettiin 19-luvun lopulla ja 20-luvun alussa, paleontologit työskenteli ymmärtääkseen eläinten historiaa kautta aikojen yhdistämällä tunnettuja ryhmiä. Kanssa moderni evoluution synteesi 1940-luvun alussa vallitsi olennaisesti moderni käsitys pääryhmien kehityksestä. Koska evoluutiotaksonomia perustuu Linnaean taksonomisiin luokkiin, nämä kaksi termiä ovat suurelta osin keskenään vaihdettavissa nykyaikaisessa käytössä.
- kladistinen menetelmä on ollut käytössä 1960-luvulta lähtien. Vuonna 1958, Julian Huxley käytti termiä haaran. Myöhemmin, vuonna 1960, Cain ja Harrison esittelivät termin kladistinen. Keskeinen piirre on taksonien järjestäminen hierarkkiseen järjestykseen evoluutiopuu, sillä toivomuksella, että kaikki nimetyt taksonit ovat monofyleettisiä. Taksonia kutsutaan monofyleettiseksi, jos se sisältää kaikki esi-isämuodon jälkeläiset. Ryhmiä, joista on poistettu jälkeläiset, kutsutaan nimellä parafyyttinen, kun taas ryhmiä, jotka edustavat useampaa kuin yhtä oksaa elämänpuusta, kutsutaan polyfyleettinen. Monofylettiset ryhmät tunnistetaan ja diagnosoidaan sen perusteella synapomorfiat, jaetut johdetut merkkitilat.
Kladistiset luokitukset ovat yhteensopivia perinteisen Linnean taksonomian ja Codes of:n kanssa Eläintieteellinen ja Kasvitieteellinen nimikkeistö. Vaihtoehtoinen nimikkeistöjärjestelmä, Kansainvälinen fylogeneettisen nimikkeistön koodi or PhyloCode on ehdotettu, jonka tarkoituksena on säännellä kladien muodollista nimeämistä.[epäluotettava lähde?] Linnaean riveissä on valinnainen alle PhyloCode, jonka on tarkoitus toimia rinnakkain nykyisten, arvoperusteisten koodien kanssa. Nähtäväksi jää, hyväksyykö järjestelmällinen yhteisö sen PhyloCode tai hylkää se nykyisten nimikkeistöjärjestelmien hyväksi, joita on käytetty (ja tarvittaessa muutettu) yli 250 vuoden ajan.
Ennen Carl Linnaeuksen (kasvitieteilijä) löytämistä kasveja ja eläimiä pidettiin erillisinä kuningaskuntia.[epäluotettava lähde?] Linnaeus käytti tätä huippuluokkana jakaen fyysisen maailman kasvi-, eläin- ja mineraalivaltakuntiin. Mikroskoopin edistyessä mikro-organismien luokittelun mahdollistaessa valtakuntien lukumäärä kasvoi, viiden ja kuuden valtakunnan järjestelmät olivat yleisimpiä.
Verkkotunnukset ovat suhteellisen uusi ryhmä. Ensimmäinen ehdotus vuonna 1977, Carl Woese's kolmen verkkotunnuksen järjestelmä hyväksyttiin yleisesti vasta myöhemmin. Yksi kolmen verkkoalueen menetelmän pääominaisuus on erottaminen archaea ja Bakteerit, aiemmin ryhmitelty yhdeksi valtakunnaksi Bakteerit (valtakuntaa kutsutaan myös joskus Monera), jossa eukaryota kaikille organismeille, joiden solut sisältävät a tuma. Pieni joukko tiedemiehiä sisältää kuudennen valtakunnan, Archaean, mutta eivät hyväksy domain-menetelmää.
Thomas Cavalier-Smith, joka julkaisi laajasti luokittelusta protisteja, 2002issa ehdotti, että Neomura, kladi, joka yhdistää Arkean ja Eucarya, olisi kehittynyt bakteereista, tarkemmin sanottuna Actinomycetota. Hänen vuoden 2004 luokituksensa käsiteltiin arkeobakteerit osana kuningaskunnan Bacteria alivaltakuntaa, eli hän hylkäsi kolmen tason järjestelmän kokonaan. Stefan Luketa ehdotti vuonna 2012 viiden "dominion" -järjestelmää ja lisäsi Prionobiota (soluton ja ilman nukleiinihappo) Ja Virusobiota (solukko mutta with nukleiinihappo) perinteiseen kolmeen domeeniin.
Linné 1735 |
Haeckel 1866 |
Chatton 1925 |
copeland 1938 |
Whittaker 1969 |
Woese et ai. 1990 |
cavalier smith 1998 |
cavalier smith 2015 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2 valtakuntaa | 3 valtakuntaa | 2 imperiumia | 4 valtakuntaa | 5 valtakuntaa | 3-verkkotunnukset | 2 imperiumia, 6 valtakuntaa | 2 imperiumia, 7 valtakuntaa |
(ei hoidettu) | protisti | Prokaryota | Monera | Monera | Bakteerit | Bakteerit | Bakteerit |
archaea | archaea | ||||||
eukaryota | protoktio | protisti | Eucarya | alkueläimet | alkueläimet | ||
Chromista | Chromista | ||||||
kasvillisuus | Plantae | Plantae | Plantae | Plantae | Plantae | ||
Sienet | Sienet | Sienet | |||||
Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia |
Monille yksittäisille organismiryhmille on olemassa osittaisia luokituksia, ja niitä tarkistetaan ja korvataan, kun uutta tietoa tulee saataville. kuitenkin kattavat, julkaistut hoidot suurimmasta osasta tai koko elämästä ovat harvinaisempia; tuoreet esimerkit ovat Adl et al., 2012 ja 2019, joka kattaa vain eukaryootit painottaen protisteja, ja Ruggiero et al., 2015, joka kattaa sekä eukaryootit että prokaryooteissa Ritarikunnan arvoon, vaikka molemmat eivät sisällä fossiilien edustajia. Erillinen kokoelma (Ruggiero, 2014) kattaa olemassa olevat taksonit perheen arvoon. Muita tietokantapohjaisia hoitoja ovat mm Elämän tietosanakirja, The Maailmanlaajuinen biologista monimuotoisuutta koskeva tietojärjestelmä, The NCBI taksonomian tietokanta, The Väliaikainen meri- ja muiden sukujen rekisteri, The Avaa elämän puu, ja Elämän luettelo. Paleobiologian tietokanta on fossiilien resurssi.
Biologinen taksonomia on alatieteenala biologia, ja sitä harjoittavat yleensä "taksonomistina" tunnetut biologit, vaikka he ovatkin innostuneita luonnontieteilijöitä ovat myös usein mukana uusien taksonien julkaisemisessa. Koska taksonomia pyrkii kuvaamaan ja järjestämään elämä, taksonomistien tekemä työ on olennaista tutkimuksen kannalta biodiversiteetti ja tuloksena oleva kenttä suojelubiologia.
Biologinen luokittelu on taksonomisen prosessin kriittinen osa. Tämän seurauksena se ilmoittaa käyttäjälle, mitä taksonin sukulaisten oletetaan olevan. Biologisessa luokituksessa käytetään taksonomisia luokituksia, mukaan lukien muun muassa (järjestyksessä kattavimmasta vähiten kattavaan): Domain, Valtakunta, pääjakso, luokka, Tilaa täältä, Perhe, suku, lajija rasitus.[huomautus 1]
Taksonin "määritelmä" kapseloituu sen kuvaukseen tai diagnoosiin tai molempiin yhdistettynä. Taksonien määrittelyä varten ei ole olemassa tiettyjä sääntöjä, mutta uusien taksonien nimeäminen ja julkaiseminen säännellään säännöillä. In eläintiede, The nimistö yleisemmin käytetyille riveille (superperhe että alalaji), sääntelee Kansainvälinen eläintieteellisen nimikkeistön koodi (ICZN-koodi). Aloilla fysiologia, mykologianja kasvitiede, taksonien nimeämistä säätelee Kansainvälinen levien, sienten ja kasvien nimikkeistön koodi (ICN).
Taksonin alkuperäinen kuvaus sisältää viisi päävaatimusta:
Usein mukana on kuitenkin paljon enemmän tietoa, kuten taksonin maantieteellinen levinneisyys, ekologiset huomautukset, kemia, käyttäytyminen jne. Se, miten tutkijat päätyvät taksoniensa, vaihtelee: käytettävissä olevista tiedoista ja resursseista riippuen menetelmät vaihtelevat yksinkertaisista määrällinen or laadullinen silmiinpistävien ominaisuuksien vertailuja suurten määrien tietokoneanalyysien laatimiseksi DNA-sekvenssi tietoja.
Tieteellisen nimen perään voidaan sijoittaa "viranomainen". Auktoriteetti on nimen ensimmäisenä pätevästi julkaissut tiedemies tai tutkijoiden nimi. Esimerkiksi vuonna 1758 Linnaeus antoi Aasian norsu tieteellinen nimi Elefas maximus, joten nimi kirjoitetaan joskus "Elefas maximus Linnaeus, 1758". Kirjoittajien nimet lyhennetään usein: lyhenne L.Varten Linnaeus, käytetään yleisesti. Kasvitieteessä on itse asiassa säännelty luettelo vakiolyhenteistä (katso luettelo kasvitieteilijöistä tekijän lyhenteiden mukaan). Valtuuksien myöntämisjärjestelmä vaihtelee hieman kasvitiede ja eläintiede. Vakiona on kuitenkin, että jos lajin suku on muuttunut alkuperäisen kuvauksen jälkeen, alkuperäisen viranomaisen nimi merkitään sulkeisiin.
Fenetiikassa, joka tunnetaan myös nimellä taksimetriikka tai numeerinen taksonomia, organismit luokitellaan yleisen samankaltaisuuden perusteella riippumatta niiden fysiologiasta tai evoluutiosuhteista. Se johtaa hypergeometrisen "etäisyyden" mittaan taksonien välillä. Feneettisistä menetelmistä on tullut suhteellisen harvinaisia nykyaikana, ja ne ovat suurelta osin syrjäytyneet kladistinen analyyseja, koska feneettiset menetelmät eivät erottele yhteisiä esi-isiä (tai plesiomorfinen) piirteitä jaetuista johdetuista (tai apomorfinen) ominaisuuksia. Kuitenkin tietyt feneettiset menetelmät, kuten naapuri mukaan, ovat pysyneet nopeina suhteiden arvioijina, kun kehittyneemmät menetelmät (kuten Bayesin päätelmä) ovat laskennallisesti liian kalliita.
Nykyaikaiset taksonomian käyttötavat tietokanta tekniikoita luokittelujen ja niiden dokumentaation etsimiseen ja luetteloimiseen. Vaikka yleisesti käytettyä tietokantaa ei ole, on olemassa kattavia tietokantoja, kuten Elämän luettelo, joka yrittää luetella kaikki dokumentoidut lajit. Luettelossa lueteltiin 1.64 miljoonaa lajia kaikista valtakunnista huhtikuussa 2016, mikä väitti kattavuuden yli kolme neljäsosaa modernin tieteen tuntemista arvioiduista lajeista.